Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms