Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms