Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TLE4Q04727 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TLE4Q04727 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms