Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms