Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPCQ03188 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms