Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCNT1Q02742 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms