Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms