Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms