Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms