Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms