Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms