Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG7P83436 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms