Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms