Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms