Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXW4P57775 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms