Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMDP57764 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMDP57764 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms