Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ME1P48163 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ME1P48163 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ME1P48163 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ME1P48163 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ME1P48163 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ME1P48163 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ME1P48163 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ME1P48163 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ME1P48163 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ME1P48163 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms