Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRATP43155 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRATP43155 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRATP43155 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms