Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASRP41180 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASRP41180 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASRP41180 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms