Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms