Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms