Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CRABP1P29762 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CRABP1P29762 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CRABP1P29762 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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