Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms