Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR2AP28223 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms