Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PLNP26678 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms