Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTX3P26022 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTX3P26022 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms