Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms