Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms