Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD247P20963 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD247P20963 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD247P20963 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms