Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMPD1P17405 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms