Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms