Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 OR4B1-201ENST00000309562 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HOXB1P14653 LHFPL3-AS1-202ENST00000416376 866 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HOXB1P14653 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB1P14653 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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