Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL4P13236 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL4P13236 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms