Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP2C9P11712 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms