Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNOT4O95628 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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