Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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