Protein–RNA interactions for Protein: O75608

LYPLA1, Acyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPLA1O75608 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYPLA1O75608 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYPLA1O75608 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms