Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB3O43889 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB3O43889 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms