Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SYNJ2O15056 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNJ2O15056 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms