Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms