Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms