Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC169A6NNP5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms