Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms