Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
V9GY48 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
V9GY48 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
V9GY48 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
V9GY48 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
V9GY48 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
V9GY48 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.54■■■□□ 2
V9GY48 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
V9GY48 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
V9GY48 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
V9GY48 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
V9GY48 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
V9GY48 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
V9GY48 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.53■■■□□ 2
V9GY48 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
V9GY48 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
V9GY48 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
V9GY48 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
V9GY48 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
V9GY48 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
V9GY48 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
V9GY48 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
V9GY48 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
V9GY48 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
V9GY48 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
V9GY48 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
V9GY48 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
V9GY48 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
V9GY48 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
V9GY48 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
V9GY48 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
V9GY48 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
V9GY48 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
V9GY48 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
V9GY48 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
V9GY48 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
V9GY48 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
V9GY48 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
V9GY48 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
V9GY48 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
V9GY48 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
V9GY48 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
V9GY48 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
V9GY48 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
V9GY48 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
V9GY48 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
V9GY48 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
V9GY48 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
V9GY48 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
V9GY48 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
V9GY48 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
V9GY48 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
V9GY48 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
V9GY48 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
V9GY48 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
V9GY48 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
V9GY48 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
V9GY48 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
V9GY48 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
V9GY48 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
V9GY48 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
V9GY48 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
V9GY48 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
V9GY48 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
V9GY48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
V9GY48 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
V9GY48 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
V9GY48 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
V9GY48 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
V9GY48 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
V9GY48 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
V9GY48 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
V9GY48 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
V9GY48 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
V9GY48 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
V9GY48 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
V9GY48 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
V9GY48 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
V9GY48 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
V9GY48 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms