Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFRSF11AQ9Y6Q6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms