Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00312Q9Y6C7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00312Q9Y6C7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms