Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX13Q9Y5W8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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