Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF3C3Q9Y5Q9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GTF3C3Q9Y5Q9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms