Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CD2APQ9Y5K6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD2APQ9Y5K6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD2APQ9Y5K6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CD2APQ9Y5K6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD2APQ9Y5K6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD2APQ9Y5K6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD2APQ9Y5K6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD2APQ9Y5K6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms