Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC46.41■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC46.38■■■■■ 5.02
DCAF1Q9Y4B6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC46.38■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC46.29■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.25■■■■■ 5
DCAF1Q9Y4B6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC46.19■■■■■ 4.99
DCAF1Q9Y4B6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms